Ředitel stojí v čele ÚCL, je jeho statutárním orgánem. Jedná za ÚCL ve všech věcech, pokud jimi nepověřil jiné vedoucí zaměstnance ÚCL, zastupuje ÚCL směrem k Ministerstvu dopravy.
Určuje koncepci činností ÚCL,
stanoví hlavní úkoly ÚCL v souladu s jeho působností dle právních předpisů,
schvaluje plány činností a rozpočet ÚCL,
předkládá ministru dopravy realizační výstupy činností jednotlivých útvarů ÚCL,
vydává akty řízení k plnění úkolů uložených právními předpisy,
rozhoduje o organizační struktuře ÚCL a stanoví rozsah pravomoci a odpovědnosti útvarů a vedoucích zaměstnanců a o počtu zaměstnanců v útvarech ÚCL,
rozhoduje o platovém zařazení vedoucích útvarů,
rozhoduje o všech pracovněprávních záležitostech,
rozhoduje o zřízení, sloučení, rozdělení a zrušení jednotlivých útvarů ÚCL,
rozhoduje v dalších věcech, jejichž rozhodnutí si sám vyhradí,
rozhoduje o návrzích zejména náhradové a likvidační komise,
jmenuje a odvolává vedoucí zaměstnance určené v § 6 odst. 6 tohoto řádu,
řeší kompetenční spory mezi útvary ÚCL a spory mezi jím přímo řízenými vedoucími zaměstnanci ÚCL,
povoluje a schvaluje zahraniční pracovní cesty zaměstnanců ÚCL,
zřizuje operativní týmy odborníků řízené vedoucími řešiteli úkolů.